Ipinaliwanag: Alin ang mga variant ng Covid-19 sa India, at ipinapaliwanag ba nila ang pag-akyat?

Mahigit sa 320 na mga sample ng coronavirus ang natagpuang may linya ng UK sa Punjab. Ipinapaliwanag ba nito ang kamakailang pag-akyat? At gaano kalawak ang mga variant ng South Africa at Brazil, bukod sa iba pa sa India?

Sa isang mall sa Pune (Express Photo: Ashish Kale, File)

Mahigit sa 320 na mga sample ng coronavirus mula sa Punjab ang natagpuang mayroon ang lahi ng UK , isang reference sa isang bagong strain ng virus na lumitaw sa UK noong Disyembre, na may genetic mutations na nagbigay-daan sa pagkalat nito nang mas mabilis. Ito ang pinakalaganap na paglitaw ng variant ng UK sa populasyon ng India na natagpuan hanggang sa kasalukuyan, at posibleng ipaliwanag ang mabilis na pag-akyat ng mga kaso sa Punjab sa nakalipas na ilang linggo.

Newsletter| Mag-click upang makuha ang pinakamahusay na mga tagapagpaliwanag ng araw sa iyong inbox

Ang isang pahayag ng gobyerno noong Miyerkules ay nagsabi na 736 na mga sample mula sa buong bansa ang natagpuang may linya ng UK. Bukod sa mga ito, 34 na sample ang natagpuang may angkan sa Timog Aprika, at ang isa ay may angkan ng Brazil. Ang mga variant ng South Africa at Brazilian ay dalawa pang nangingibabaw na strain ng coronavirus na kumakalat sa buong mundo. Ang genetic mutations sa dalawang variant na ito ay nagiging mas malamang na makatakas sa immune system ng tao. Ang pangamba, samakatuwid, ay ang mga kasalukuyang bakuna ay maaaring medyo hindi gaanong epektibo laban sa kanila, kahit na ito ay iniimbestigahan pa rin.

Mga variant sa India

Ang mga variant ng UK, Brazilian at South Africa ay hindi lamang ang kasalukuyang umiikot sa populasyon ng India. Tulad ng anumang iba pang organismo, ang coronavirus ay patuloy ding nagmu-mutate, na may ilang pagbabago sa genetic structure nito na nangyayari sa bawat replication cycle. Karamihan sa mga mutasyon na ito ay hindi mahalaga, at hindi binabago ang pangkalahatang katangian o pag-uugali ng coronavirus. Ngunit ang ilan sa kanila, posibleng isa sa libu-libo, ay maaaring magpakilala ng mahahalagang pagbabago, na tumutulong sa virus na umangkop o makaligtas nang mas mahusay.

Sa panahon ng epidemya na ito, tatlong uri ng mga pagbabago ang matamang binabantayan — yaong nagpapataas ng kakayahan ng virus na kumalat nang mas mabilis, yaong nagdudulot ng mas matinding sakit sa taong nahawahan, at yaong tumutulong sa virus na makatakas sa immune response.

Ang mga variant ng UK, Brazilian at South Africa ay ganoong mga strain. Ang bawat isa sa kanila ay mayroon na ngayong sariling mga pamilya, ibig sabihin ay nagkaroon ng maraming kasunod na mutasyon sa mga ito ngunit sa orihinal na pagtukoy ng mutation ay nananatiling buo. Ang tatlong variant na pamilya, o lineage, ay natagpuan sa maraming bansa, at pangunahing responsable para sa pagdami ng mga kaso sa Europe at Brazil.

Bukod sa mga ito, maraming iba pang mga variant ang umiikot sa populasyon ng India, ang mga mayroon nagmula sa lokal pati na rin ang iba na dinala ng mga manlalakbay mula sa ibang bansa. Ngunit wala sa mga ito ang naiuri bilang isang variant ng alalahanin.

May nakitang mga variant ng Covid-19 sa India

Variant at alalahanin sa UK Covid-19

Nanindigan ang mga siyentipiko na wala sa tatlong 'variant of concern' - UK, Brazilian o South African - ang maaaring maiugnay sa kasalukuyang pagtaas ng mga kaso sa India. Ang kanilang antas ng pagkalat sa komunidad, sa ngayon, ay hindi masyadong mataas na ang kasalukuyang pag-akyat ay maaaring maiugnay sa kanila.

Maging sa Punjab, kung saan 80% ng 400 sample na nasuri ay naging variant ng UK, masyadong maaga para sisihin ito sa pambihirang pagtaas ng mga kaso nitong nakaraang ilang linggo. Ang mga resulta ng genome sequencing ay naihayag na ngayon, at isang klinikal na ugnayan ang kailangang gawin upang masuri kung sila ang may pananagutan sa pagtaas ng mga kaso.

Tulad ng itinuro ng mga siyentipiko, kung ang mga taong nahawaan ng UK strain sa Punjab ay lahat ng mga manlalakbay, o ang kanilang mga direktang kontak, kung gayon ang kanilang mga pangyayari ay madaling maipaliwanag, at hindi masyadong nakakabahala. Gayunpaman, kung ito ay natagpuan din sa mga tao sa mas malawak na komunidad, kung gayon mayroong panganib ng pagkalat nito sa iba nang napakabilis. Nangangahulugan din ito na ang mga pamamaraan ng paghihiwalay at kuwarentenas na sinusunod sa estado, lalo na para sa mga manlalakbay, ay hindi masyadong mahigpit na sinusunod.

Ang ilang partikular na mutasyon na natagpuan sa strain ng UK, tulad ng isang pinangalanang E484Q at isa pang tinatawag na N440K, ay nakita din sa ilang iba pang mga variant, at ang mga ito ay umiikot sa populasyon ng India sa loob ng ilang buwan. Sa kasalukuyan, walang katibayan na magmumungkahi na ang alinman sa mga ito ay maaaring humantong sa pangalawang pag-akyat, o nagdulot ng muling impeksyon sa mga pasyente.

Gayunpaman, mas detalyadong siyentipikong pagsisiyasat ang kinakailangan upang masuri ang kanilang epekto sa pagkalat ng sakit sa India.

Genome sequencing...

Ang India ay ang pangalawang pinakamataas na bilang ng mga taong nahawahan ng coronavirus sa panahon ng epidemya. Ngunit nakagawa ito ng napakakaunting genome sequences ng iba't ibang variant sa sirkulasyon. Sa ngayon, nagsagawa ito ng pagsusuri ng gene ng 19,092 na mga sample mula sa buong bansa, ayon sa isang pahayag na ginawa ng gobyerno sa Parliament noong nakaraang linggo. Kabilang dito ang pagkakasunud-sunod ng 10,787 sample mula noong i-set up ng gobyerno ang INSACOG (Indian SARS-CoV2 Consortium on Genomics) noong Disyembre partikular para sa layuning ito. Maraming iba pang mga bansa, kabilang ang Estados Unidos at China, ang nagsuri ng higit sa 100,000 mga pagkakasunud-sunod ng gene.

Ang pag-aaral ng mga pagbabago sa genetic sa organismo ay mahalagang mga pahiwatig upang maunawaan ang pinagmulan, paghahatid at epekto ng virus sa mga pasyente. Ang nakasaad na layunin ng INSACOG ay ang pagkakasunud-sunod ng mga sample mula sa hindi bababa sa 5% ng lahat ng mga nahawaang kaso sa pamamagitan ng isang network ng sampung laboratoryo. Mukhang napakataas na utos ngayon. Sa ngayon, naitala ng India ang mahigit 1.17 crore na positibong kaso. Ang 19,092 na mga sample na nagkasunod-sunod hanggang ngayon ay bumubuo lamang ng 0.16% ng bilang na iyon.

SUMALI KA NA :Ang Express Explained Telegram Channel

… at bakit naging mabagal

Ang isa sa mga pangunahing dahilan para sa mabagal na bilis ng genome sequencing ay ang kakulangan ng mga pondo. Sa ngayon, walang pera na inilaan para sa INSACOG, bagaman sinabi ng mga opisyal na ang pag-apruba para sa mga pondo ay inaasahan na ngayon anumang araw. Ang mga laboratoryo ay gumagamit ng pera mula sa kanilang sariling taunang mga badyet upang gawin ang pagkakasunud-sunod na gawain. Tumatagal sa pagitan ng Rs 3,000 at Rs 5,000 upang makuha ang pagkakasunud-sunod ng gene ng isang sample. Ang gastos ay pangunahin sa mga kemikal na reagents na kinakailangan sa proseso.

Gayundin, ang mga estado ay hindi pa proactive na nagpapadala ng kanilang mga sample sa mga laboratoryo para sa sequencing. Ang Maharashtra, na nakapagtala ng higit sa 25 lakh na impeksyon hanggang ngayon, ay nagpadala lamang ng humigit-kumulang 2,800 mga sample para sa pagkakasunud-sunod, ayon sa data ng gobyerno na ipinakita sa Parliament. Iyan ay halos 0.11% lamang ng lahat ng mga kaso. Ang Kerala ay nagpadala ng pinakamataas na bilang ng mga sample para sa sequencing, mga 5,200, ngunit ang Karnataka, na may maihahambing na bilang ng mga kaso, ay nagpadala lamang ng 137 na mga sample. Ang ganitong mababang rate ng genome sequencing ay maaaring hindi makabuluhan ayon sa istatistika upang makagawa ng mga konklusyon tungkol sa pagbabago ng kalikasan at pag-uugali ng virus, o sa pagdidisenyo ng mga naaangkop na interbensyon upang mapigil ang pagkalat ng epidemya.

Ang artikulong ito ay unang lumabas sa print na edisyon noong Marso 25, 2021 sa ilalim ng pamagat na 'Cracking the virus strain'.

Ibahagi Sa Iyong Mga Kaibigan: