Ipinaliwanag: Limang hakbang sa pag-detect ng coronavirus (COVID-19)

Ang proseso ay ipinaliwanag sa The Indian Express ni Dr V Ravi, Senior Professor at Head, Department of Neurovirology, NIMHANS.

Ang pekeng dugo ay nakikita sa mga test tube na may label na coronavirus (COVID-19) sa larawang ito na kinuha noong Marso 17, 2020. (Reuters)

Ipinapaliwanag ni Dr V Ravi, Senior Professor at Head, Department of Neurovirology, NIMHANS, ang proseso ng pagtuklas ng coronavirus sa ang website na ito . Narito ang limang hakbang:

Pagkolekta at transportasyon

Ang testing center ay kumukuha ng mga pamunas mula sa mga lukab ng ilong at likod ng lalamunan (pharynx), at naglalagay ng mga sample sa isang virus transport medium, na naglalaman ng balanseng mga asing-gamot at albumin upang maiwasan ang pagkawatak-watak ng virus. Ang sample ay dinadala sa malamig na imbakan sa testing lab.

Pagkuha ng viral RNA

Ang mga coronavirus tulad ng SARS-CoV (na lumitaw sa China noong 2002-03), MERS-CoV (na lumabas sa Saudi Arabia noong 2012), o ang kasalukuyang SARS-CoV-2 na naging sanhi ng pandemya ng COVID-19, ay may malaking , mga single-stranded na RNA genome. Kinukuha ng testing lab ang RNA mula sa mga sample, gamit ang mga kit na available sa komersyo (gaya ng mga ginawa ng mga kumpanya tulad ng QIAGEN.)

Ang paglalagay ng THE RNA sa THE PCR mix

Ang na-extract na RNA ay idinaragdag sa isang polymerase chain reaction (PCR) mix. Kabilang dito ang 'master mix', na naglalaman ng isang 'reverse transcriptase' enzyme na nagpapalit ng RNA sa DNA. Ang master mix ay naglalaman ng Taq polymerase, ang enzyme na lumilikha ng mga kopya ng DNA, mga nucleotides, pati na rin ang iba pang elemento tulad ng magnesium - isang ion na kinakailangan upang palakasin ang DNA.

Ang PCR mix ay naglalaman din ng 'reagents' tulad ng 'primers' at 'probes'. Ang mga panimulang aklat ay partikular na mga hibla ng DNA na idinisenyo upang magbigkis sa DNA na dapat kopyahin; probes ay ginagamit upang makita ang tiyak na pagkakasunud-sunod sa sample ng DNA. Ang WHO ay nagrekomenda ng mga partikular na primer at probe para sa pagsusuri para sa COVID-19.

Sa wakas, ang PCR mix ay binubuo ng isang housekeeping gene - isang normal na gene ng tao (RNase P) na ginagamit upang matiyak na ang mga sample ay maayos na nakolekta, at nakuha ang RNA.

Pagpapalakas ng viral DNA

Ang sample, sa PCR mix nito, ay inilalagay sa mga tubo o mga plato, na pagkatapos ay ilagay sa isang thermal cycler machine na ginagamit upang isagawa ang proseso ng PCR.

Una, ang RNA ay na-convert sa DNA. Pagkatapos ay magsisimula ang proseso ng pagkopya ng mga gene. Pinapainit at pinapalamig ng thermal cycler ang pinaghalong may sample, na nagpapalit sa pagitan ng tatlong temperatura — para sa pagtunaw ng DNA upang paghiwalayin ang dalawang strand, para sa primer na magbigkis sa DNA, at para sa pagbubuo ng bagong strand — lahat sa loob ng isang cycle na tumatagal ng isang minuto. Ang thermal cycler ay nagpapatakbo ng 30-40 tulad ng mga siklo upang palakasin ang DNA upang suriin ang virus.

Pagsubok laban sa mga kontrol

Sinusuri ang amplified DNA laban sa isang positibong kontrol, na karaniwang binubuo ng mga gene ng virus na na-clone sa plasmid, at isang negatibong kontrol, na isang 'kilala' na sample na nagsubok ng negatibo para sa virus kanina.

Ang RNase P ay dapat magpakita ng amplification, ang positibong kontrol ay dapat na positibo, ang negatibong kontrol ay dapat na negatibo, at pagkatapos ay anuman ang resulta na makuha mo para sa ispesimen, ay ang tamang resulta, sabi ng neurovirologist na si Dr V Ravi. Upang maging wasto ang isang pagsubok bago ilabas ang resulta, kailangang matugunan ang ilang partikular na ‘pamantayan sa bisa.

Huwag palampasin mula sa Explained | Paano gumagana ang pagsusuri sa COVID-19

Kung ang housekeeping gene (RNase P) ay positibo, positibong kontrol ay positibo, negatibong kontrol ay negatibo, at ang sample ay hindi nagpapakita ng anumang PCR positibong resulta, ang sample ay idineklara na negatibo para sa SARS-CoV-2 virus RNA. Kung positibo ang resulta ng PCR, may COVID-19 ang pasyente.

Ibahagi Sa Iyong Mga Kaibigan: