Ipinaliwanag: Paano gumagana ang pagsusuri sa coronavirus (COVID-19).

Paano tinitingnan ng PCR test ang virus sa mga sample ng pamunas? Gaano katagal ito? Ilang sample ang sinusuri ng India araw-araw, at maaari ba itong sumubok ng higit pa? Kung kaya naman, bakit hindi pa na-scale up?

Kasalukuyang nagsasagawa ang India ng dalawang yugto ng real-time na PCR upang masuri ang SARS-COV-2. (Reuters)

Ano ang diagnostic test para sa novel coronavirus na nagdudulot ng COVID-19?

Ang Ang Indian Council of Medical Research (ICMR) ay nagsabi ng mga itinalagang lab gagamit ng conventional real-time polymerase chain reaction (PCR) test, na isinasagawa sa swab na nakolekta mula sa likod ng lalamunan, isang sample ng likido mula sa lower respiratory tract, o isang simpleng sample ng laway. Ang mga naturang pagsusuri ay karaniwang ginagamit sa Influenza A, Influenza B at H1N1 virus detection.

Ano ang PCR test?

Gumagamit ito ng pamamaraan na lumilikha ng mga kopya ng isang segment ng DNA. Ang 'Polymerase' ay tumutukoy sa mga enzyme na gumagawa ng mga kopya ng DNA. Ang 'chain reaction' ay kung paano kinopya ang mga fragment ng DNA, exponentially - ang isa ay kinopya sa dalawa, ang dalawa ay kinopya sa apat, at iba pa. Si Kary Mullis, ang American biochemist na nag-imbento ng PCR technique, ay ginawaran ng Nobel Prize for Chemistry noong 1993.

Gayunpaman, ang SARS-COV-2 ay isang virus na gawa sa RNA, na kailangang i-convert sa DNA. Para dito, kasama sa pamamaraan ang isang prosesong tinatawag na reverse transcription. Ang isang 'reverse transcriptase' enzyme ay nagpapalit ng RNA sa DNA. Ang mga kopya ng DNA ay ginagawa at pinapalaki. Ang isang fluorescent DNA binding dye na tinatawag na probe ay nagpapakita ng presensya ng virus. Tinutukoy din ng pagsusuri ang SARS-COV-2 mula sa iba pang mga virus.

Gaano katagal ang proseso ng PCR?

Ang mga real-time na PCR ay nagpababa sa oras na kinuha upang subukan ang mga sample sa 4.5 na oras mula sa humigit-kumulang 6 na oras na mas maaga, sinabi ng ICMR scientist na si Dr RR Gangakhedkar. Gayunpaman, ang kabuuang oras ng turnaround —mula sa oras na kinolekta ang mga sample hanggang kapag naihatid ang ulat — ay humigit-kumulang 24 na oras, at dapat ay mas kaunti, aniya.

Ipinaliwanag: Limang hakbang upang matukoy ang coronavirus

Paano ginagawa ang pagsusulit sa India?

Kasalukuyang nagsasagawa ang India ng dalawang yugto ng real-time na PCR upang masuri ang SARS-COV-2, sabi ni NIMHANS Senior Professor at Head of Neurovirology, Dr V Ravi. Ang unang yugto ay idinisenyo upang makita ang mga genetic na elemento na karaniwan sa mga coronavirus ng tao na maaaring umiiral sa sample. Ang ikalawang yugto ay idinisenyo upang subukan ang mga partikular na gene na naroroon lamang sa SARS-COV-2 na virus.

Hanggang sa simula ng Marso, ang paunang screening Ang pagsubok upang suriin para sa anumang uri ng coronavirus ay ginawa ng lahat ng mga lab, ngunit ang confirmatory PCR ay ginawa lamang ng National Institute of Virology sa Pune. Pagkatapos, inilipat ng NIV Pune ang teknolohiya (kinakailangan ang mga reagent para sa kumpirmasyon) sa lahat ng lab upang hindi na kailanganin ng sample na pumunta sa Pune. Nabawasan nito ang oras na kinuha upang subukan ang mga sample, sinabi ni Dr Ravi.

Pagsusuri sa Coronavirus: Ang pekeng dugo ay nakikita sa mga test tube na may label na coronavirus ( COVID-19 ) sa larawang ito na kinuha noong Marso 17, 2020. (Ilustrasyon ng Reuters: Dado RuvicO

Ang India ba ay sumusubok ng sapat na mga numero?

May kapasidad ang India na subukan ang 10,000 sample araw-araw, at kasalukuyang sinusubok ang humigit-kumulang 600-700. Sa paghahambing, ang South Korea, na may katulad na oras ng turnaround, ay iniulat na sumusubok ng hanggang 20,000 sample sa isang araw, lalo na gamit ang mga modelo tulad ng mga pasilidad sa pagsubok ng drive-through nito.

Naniniwala ang gobyerno na hindi kinakailangan sa yugtong ito na subukan ang bawat tao. Sinusubukan ng bansa ang cohort na kailangan nitong subukan sa ngayon, sabi ni Dr Gangakhedkar. Kung pupunta ka sa pamamagitan ng localized transmission, sapat na ang pagsubok namin. Kung naniniwala ka na mayroong community-based transmission, ibang isyu ito. Wala pa ring ebidensya kung saan hindi natin alam kung paano nakuha ng index case ang impeksyong ito, aniya.

Nasa Telegram na ngayon ang Express Explained. I-click dito para sumali sa aming channel (@ieexplained) at manatiling updated sa pinakabago

Hindi namin nais na gumawa ng anumang walang pinipiling pagsubok dahil ngayon ang lahat ay humihingi ng pagsusulit. Kaya, sa isang lugar, kakailanganin nating i-rationalize ito... ngunit mahalaga din na bantayan ito para hindi tayo nawawala sa transmission ng komunidad, sinabi ng ICMR scientist na si Dr Nivedita Gupta sa isang press briefing noong nakaraang linggo.

Ano ang magiging diskarte kung mangyari ang paghahatid ng komunidad?

Ang ICMR ay nagsasagawa ng pagsubaybay para sa anumang ebidensya ng paghahatid ng komunidad, kung saan ang bawat isa sa 52 testing lab ng India ay sumusubok sa 20 random na sample ng mga pasyenteng may Severe Acute Respiratory Infection (SARI). Ang 'unang pagputol' ng mga pagsusulit na ito ay inaasahang lalabas sa Miyerkules. Sinabi ng ICMR na, kung sakaling ang isang kaso ng paghahatid ng komunidad ay mahukay mula sa mga pagsubok sa pagsubaybay na ito, ang mga estratehiya ng pamahalaan ay ganap na magkakaiba.

Pandemya ng Coronavirus: Sa isang ospital sa New Delhi. (PTI Photo/File)

Mayroon bang mga hadlang sa pagpapalaki ng pagsubok?

Ang gastos ay isang potensyal na hadlang, pakiramdam ng ilang mga eksperto. Sinabi ng mga opisyal ng ICMR sa isang kumperensya na ang halaga ng isang pangunahing pagsusuri para sa COVID-19 ay Rs 1,500. Kung ang pangalawang pagsubok ay gagawin upang kumpirmahin ang mga resulta ng unang pagsubok, ang kabuuang halaga ay nasa Rs 5,000. Sinabi rin ng isa sa mga opisyal na ang mga probes na ginamit, na na-import mula sa Germany, ay isang limiting factor.

Habang ang bilang ng mga sentro ng pagsubok ay nadagdagan, ang mga pag-import ng mga probes ay tumaas din. Noong nakaraang linggo, nais ng India na mag-import ng humigit-kumulang 200,000 probes, samantalang noong Lunes, sinabi ni Dr Gangakhedkar na pinaplano ng gobyerno na mag-import ng humigit-kumulang isang milyon.

Pandemya ng Coronavirus: Kailan susuriin at kanino

Maaaring iba ang ginagawa ng India?

Ang sinimulang gawin ng India ay eksakto kung ano ang inirerekomenda para sa isang bansa kung saan na-import ang sakit, ayon sa executive director ng Translational Health Science and Technology Institute India, si Dr Gagandeep Kang. Gayunpaman, ang pagsusuri at pag-follow-up sa mga pumapasok sa bansa, at paglalagay sa mga nakatagpo nila sa ilalim ng surveillance, ay isang makatwiran at naaangkop na diskarte kung ang tanging panganib ay ang pag-import ng sakit, at ang follow-up at pagsusuri ay 100 %, sabi niya.

Ngunit kung ano ang maaaring mangyari ay na sa impeksyon na ito maaari kang malaglag kahit na bago ka magkaroon ng mga sintomas, at sa napakakaunti ay maaaring hindi ka magkakaroon ng mga sintomas, kaya maaari mong mailipat ito sa ibang mga tao nang hindi nalalaman na ikaw ay nahawaan, aniya. Ang ganitong uri ng pagiging kumplikado… ginagawang kinakailangang pag-isipan ang tungkol sa pagkakaroon ng backup na diskarte upang makita kung mayroon ka talagang napalampas, aniya. Marami pa tayong magagawa.

Makakatulong ba ang ICMR surveillance?

Ang desisyon ng ICMR ay isang magandang hakbang, ngunit may mga rehiyon na aalisin ang naturang ehersisyo, sinabi ni Dr Kang. Kung nagsusuri ka ng mga sample bawat linggo mula sa bawat lab ng trangkaso, kung makakita ka ng kahit isang positibo, sasabihin nito sa iyo na marami kang napalampas, aniya.

Ayon kay Dr Kang, posibleng gumamit ng mathematical modeling para maunawaan kung ano ang magbibigay sa gobyerno ng makatwirang pagkakataon na matukoy kung mayroon nang anumang transmission sa komunidad. Sa palagay ko, magiging mahusay na magkaroon ng uri ng modelo na mayroon ang Singapore, kung saan ang sinumang doktor saanman na may klinikal na hinala, kahit na hindi ito akma sa paglalarawan, ay pinahintulutang magpadala ng kanilang pasyente para sa isang pagsubok, idinagdag niya.

– Mga input ni Kaunain Sheriff M

Ibahagi Sa Iyong Mga Kaibigan: