Ipinaliwanag: Ano ang 'halaga ng CT' sa isang pagsusuri sa Covid-19, at bakit ito mahalaga?

Lumalabas ang cycle threshold value sa mga RT-PCR test para sa coronavirus, at tinutukoy kung ang isang tao ay positibo para sa Covid-19 o hindi. Hanggang saan ito nauugnay sa viral load at kalubhaan ng sakit?

Nakikita ng isang RT-PCR test ang virus; Ang halaga ng Ct ay nagtatakda ng benchmark kung ang isang tao ay mabibilang na positibo. (Express na Larawan: Amit Mehra)

Sa iba't ibang pang-agham na termino na ang Covid-19 pandemic ay naging bahagi ng pampublikong bokabularyo, ang isa ay ang 'Ct value' sa mga pagsusuri sa RT-PCR para sa pagtukoy kung ang isang pasyente ay positibo para sa Covid-19.

Ito ang paksa ng kamakailang kahilingan na ipinadala ng gobyerno ng Maharashtra sa Indian Council of Medical Research (ICMR). Humingi ng kaliwanagan ang estado kung ipinapayong ituring ang isang tao bilang Covid-negative kung ang halaga ng Ct ay higit sa 24 at ang tao ay asymptomatic. Sinabi ng mga opisyal ng estado na ang iba't ibang mga dokumento ng ICMR ay nagbanggit ng iba't ibang mga halaga ng Ct at may mga magkakaibang pananaw kahit na sa Niti Aayog at ng National Center for Disease Control.

Pagkalipas ng mga araw, sumulat ang ICMR DG sa Kalihim ng Kalusugan ng estado na ang ICMR ay kumuha ng mga input mula sa mga laboratoryo ng virology sa buong bansa upang makarating sa isang solong Ct value cut-off. Ang lahat ng mga pasyente na may Ct value na mas mababa sa 35 ay maaaring ituring na positibo habang ang mga may Ct value na higit sa 35 ay maaaring ituring na negatibo, sabi ng ICMR.

Ngunit ano ang halaga ng Ct?

Maikli para sa cycle threshold, ang Ct ay isang value na lumalabas sa panahon ng mga RT-PCR test, ang gold standard para sa pagtuklas ng SARS-CoV-2 coronavirus . Sa isang pagsusuri sa RT-PCR, kinukuha ang RNA mula sa pamunas na nakolekta mula sa pasyente. Pagkatapos ito ay na-convert sa DNA, na pagkatapos ay pinalakas. Ang amplification ay tumutukoy sa proseso ng paggawa ng maraming kopya ng genetic material — sa kasong ito, DNA. Pinapabuti nito ang kakayahan ng pagsubok na makita ang pagkakaroon ng virus. Ang amplification ay nagaganap sa pamamagitan ng isang serye ng mga cycle — isang kopya ay naging dalawa, dalawa ay naging apat, at iba pa — at ito ay pagkatapos ng maraming mga cycle na ang isang nakikitang dami ng virus ay ginawa.

Ayon sa advisory ng ICMR, ang Ct value ng isang RT-PCR reaction ay ang bilang ng mga cycle kung saan makikita ang fluorescence ng PCR product sa ibabaw at sa itaas ng background signal. Sa madaling salita, ang Ct value ay tumutukoy sa bilang ng mga cycle pagkatapos na matukoy ang virus. Kung kailangan ng mas mataas na bilang ng mga cycle, ipinahihiwatig nito na hindi natukoy ang virus noong mas mababa ang bilang ng mga cycle. Kung mas mababa ang halaga ng Ct, mas mataas ang viral load - dahil nakita ang virus pagkatapos ng mas kaunting mga cycle.

Newsletter| Mag-click upang makuha ang pinakamahusay na mga tagapagpaliwanag ng araw sa iyong inbox

Bakit mahalaga ang halaga ng CT?

Upang ilagay iyon sa konteksto, tingnan natin ang ICMR advisory at ang sulat ni Maharashtra sa ICMR. Ayon sa ICMR, ang isang pasyente ay itinuturing na Covid-positive kung ang halaga ng Ct ay mas mababa sa 35. Sa madaling salita, kung ang virus ay makikita pagkatapos ng 35 cycle o mas maaga, kung gayon ang pasyente ay itinuturing na positibo. Kung ang benchmark ay ibababa sa 24 — ang halagang binanggit sa liham ni Maharashtra — nangangahulugan ito na ang mga halaga ng Ct sa hanay na 25-34 ay hindi maituturing na positibo. Ang benchmark na 35, samakatuwid, ay nangangahulugan na mas maraming pasyente ang maituturing na positibo kaysa sa makukuha natin kung ang benchmark ay 24. Sinabi ng ICMR na ang pagpapababa ng parameter ng Ct threshold ay maaaring humantong sa pagkawala ng ilang mga nakakahawang tao.

Maaaring isipin ng isa ang halaga ng Ct bilang sukatan ng potensyal ng paghahatid, sabi ng nangungunang virologist na si Dr Shahid Jameel. Kaya kung may mas maraming virus sa aking lalamunan at ilong, mas maipapasa ko ito, sabi ni Dr Jameel, na Direktor ng Trivedi School of Biosciences sa Ashoka University.

Ano ang kahalagahan ng ICMR threshold ng 35?

Sa buong mundo, ang tinatanggap na cut-off para sa Ct value para sa Covid-19 ay nasa pagitan ng 35 at 40, depende sa mga tagubilin mula sa kani-kanilang mga manufacturer ng testing equipment. Ang ICMR ay dumating sa Ct value na 35 batay sa mga karanasan sa laboratoryo at mga input na kinuha mula sa ilang virology lab.

Walang bagong advisory, ngunit ipinaalam ng ICMR sa gobyerno ng Maharashtra na hindi ipinapayong gumamit ng mas mababang cycle threshold parameter dahil ito ay hahantong sa nawawalang ilang mga nakakahawang tao at dagdagan ang paghahatid ng sakit, sinabi ni Dr Balram Bhargava, DG ng ICMR.

Mayroon bang anumang ugnayan sa pagitan ng halaga ng Ct at kalubhaan ng sakit?

Hindi. Kahit na ang halaga ng Ct ay inversely correlated sa viral load, Wala itong anumang epekto sa kalubhaan ng sakit, sabi ng mga eksperto. Ang isang pasyente ay maaaring magkaroon ng isang mababang halaga ng Ct, na nangangahulugang ang kanyang viral load ay sapat na mataas upang mabilis na matukoy, ngunit maaari pa rin siyang walang sintomas.

Ang isang maliit na pag-aaral na inilathala sa Indian Journal of Medical Microbiology noong Enero sa taong ito ay natagpuan na walang ugnayan sa pagitan ng mga halaga ng Ct at kalubhaan ng sakit o dami ng namamatay sa mga pasyente na may sakit na Covid-19. Napag-alaman na ang oras mula noong simula ng mga sintomas ay may mas malakas na kaugnayan sa mga halaga ng Ct kumpara sa kalubhaan ng sakit.

Ang halaga ng Ct ay nagsasabi sa amin tungkol sa viral load sa lalamunan at hindi sa mga baga, sabi ni Dr Parikshit Prayag, consultant para sa mga nakakahawang sakit sa Deenanath Mangeshkar Hospital, Pune. Ang halaga ng Ct ay hindi nauugnay sa kalubhaan - lamang sa pagkahawa. Sa unang ulat ay hindi ko talaga tinitingnan ang halaga ng Ct, ngunit para sa pag-follow-up ng mga pasyente sa ospital, isinasaalang-alang ko ang halaga ng Ct, para makapagdesisyon ako kung ililipat ang pasyente sa gusaling hindi Covid o hindi. . Mula sa infectivity point of view, maaari itong mahalaga, hindi ang kalubhaan, sinabi ni Dr Prayag.

Ang mataas ba na halaga ng Ct ay palaging nangangahulugan ng mababang viral load?

Bagama't iyon ang malinaw na hinuha, binibigyang-diin ng ilang eksperto na ang ilang pasyente ay maaaring magkaroon ng mataas na halaga ng Ct at mayroon pa ring napakalaking antas ng impeksyon sa Covid-19, at kabaliktaran. Maraming mga kadahilanan ang mahalaga sa pagbibigay-kahulugan sa isang pagsusuri sa RT-PCR, at ang mga resulta ay maaari ding depende sa paraan ng pagkolekta ng ispesimen at oras mula sa impeksyon hanggang sa koleksyon at sa pagsusuri.

Isang advisory ng ICMR noong Agosto noong nakaraang taon ang nagsabi na ang mga halaga ng Ct ay nakadepende sa kung paano nakolekta ang sample. Ang isang hindi magandang nakolektang sample ay maaaring magpakita ng hindi naaangkop na mga halaga ng Ct. Bukod dito, ang mga halaga ng Ct ay natutukoy din sa pamamagitan ng teknikal na kakayahan ng taong nagsasagawa ng pagsusulit, pagkakalibrate ng kagamitan, at ang mga kasanayan sa pagsusuri ng mga interpreter.

Muli, maaaring magkaiba ang mga halaga ng Ct sa pagitan ng mga specimen ng ilong at oropharyngeal na nakolekta mula sa parehong indibidwal. Ang temperatura ng transportasyon, pati na rin ang oras na kinuha mula sa koleksyon hanggang sa pagtanggap sa lab, ay maaari ding makaapekto sa mga halaga ng Ct.

Ibahagi Sa Iyong Mga Kaibigan: